Lincoln Claynek döntenie kell, hogy melyik mentora által kijelölt útvonalat követve számoljon le minden útbaállóval.
Két oldal közül választhat a vietnámi veterán. Az egyik James Ballard atya, aki adoptálta Clay-t, és lelkileg segítette idáig (elvégre egy háborút nem olyan egyszerű kiheverni), a másik pedig John Donovan, aki a CIA-nek dolgozik, és így másképp tud segíteni az olasz maffia kiiktatásában.
Ez több konfliktus forrása is lehet: Ballard papként nem nagyon tűri el a vérfürdőt, de Donovan tudna segíteni abban, hogy eltussolja az ügyeinket a hatóságokkal – bár egy végkimenetel lesz, az oda való eljutás rajtunk múlik majd. Igaz, itt talán nem lehet úgy elbukni a játékot, mint a Splinter Cell: Double Agent esetében – ott ha túlzottan egy szervezet felé hajlottunk, buktuk az adott küldetést.
New Bourdeaux városába október hetedikén léphetünk be PlayStation 4-en, Xbox One-on és PC-n – ekkor érkezik ugyanis a Mafia III.